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注释和分析

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我们是谁

以前被称为连接仪注释团队(CAT),注释和分析(A&A),于2021年9月在Janelia启动了新的共享资源。我们设想这一资源是培训的核心培训专业人士的核心小组,他们旨在为任何Janelia Research做出贡献有计算机辅助数据注释和分析需求。

节点:身体|Entity_field

我们所做的:

我们继续在果蝇电子显微镜(EM)数据集中进行连接组的持续努力,并在不同组织和器官中注释细胞细胞器。随着A&A的扩展范围,我们的目标是使用光学显微镜(LM),视频,音频和其他模式获得的其他数据类型。

我们使用内部开发的软件工具和应用程序执行注释,或者在商业上或作为开源。我们在追踪神经元和标记突触(FlyTem Project),Neutu,Neu3和Neuroglancer的CATMAID方面具有专业知识,用于注释神经元的形态和连接组(Flyem Project),因此,我们建议Janelia Lab Lab Lab heads有关满足特定项目目标的注释策略。我们还使用图像处理软件,例如Amira和Paintera(COSEM和Cellmap Projects),Fiji,Napari等人来实现新的生物学目标。我们将继续发展新技术的能力,因为它们是由生物学开发或驱动的。使用数据科学,可视化和其他分析方法,我们旨在帮助Janelians将数据转换为特定知识。

作为共享资源,我们的使命是为Janelia的科学家,项目和团队促进科学,我们旨在使Janelia合作者的专业知识在未来提供。

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