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Cosem

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项目概况
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从RAW 3D EM数据桥接到更容易解释的生物学数据。

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Janelia Research Campus的COSEM项目团队使用计算机视觉和机器学习技术来可伸缩地检测使用下一代体积电子显微镜生成的数据集中的细胞内结构,例如细胞器。

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在Janelia内是世界上一些机器学习领域的领先专家(萨尔费尔德实验室芬克实验室), 细胞生物学 (Lippincott-Schwartz实验室)和大量的高分辨率EM数据采集(赫斯实验室FIB-SEM技术集团)。在他们的交叉点上是一个独特的研究领域。COSEM正在扩展与以自动化方式识别EM数据中的亚细胞结构有关的工具和知识。结果,COSEM提供的产品包括定量分析和数据资源。它将使我们能够重新构想我们的典型教科书图像,并提供生物学的见解和知识,并以更广泛的科学界和公众开放和访问的方式来做到这一点。

wholecell_3d_600.jpg我们对原始数据集,培训数据,重建,开源代码和模型的公共存储库是科学界的邀请,以加入我们正在进行的努力,以改善和进一步发展,进一步发展,从fib-sem。我们很乐观地,这将在计算和生物领域中加速科学发现,从而导致不久的将来及以后的新的和令人兴奋的见解和方法发展。

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